Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr41Q3UDP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr41Q3UDP0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr41Q3UDP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms