Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctu2Q3U308 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctu2Q3U308 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms