Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrx1Q3TL44 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrx1Q3TL44 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrx1Q3TL44 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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