Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2f1Q3THK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms