Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem104Q3TB48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms