Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrriq3Q14DL3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrriq3Q14DL3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrriq3Q14DL3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms