Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r2Q0VGB7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r2Q0VGB7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms