Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rundc1Q0VDN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rundc1Q0VDN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rundc1Q0VDN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 315.4 ms