Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
StumQ0VBF8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StumQ0VBF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms