Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MitfQ08874 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MitfQ08874 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MitfQ08874 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MitfQ08874 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MitfQ08874 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms