Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Col17a1Q07563 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Col17a1Q07563 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Col17a1Q07563 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Col17a1Q07563 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms