Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah2Q06986 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms