Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r236Q05A06 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r236Q05A06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r236Q05A06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms