Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SryQ05738 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SryQ05738 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SryQ05738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SryQ05738 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SryQ05738 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SryQ05738 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SryQ05738 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SryQ05738 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SryQ05738 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SryQ05738 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SryQ05738 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SryQ05738 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SryQ05738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SryQ05738 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SryQ05738 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SryQ05738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SryQ05738 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SryQ05738 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SryQ05738 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SryQ05738 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SryQ05738 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SryQ05738 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SryQ05738 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SryQ05738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SryQ05738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SryQ05738 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SryQ05738 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms