Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pax5Q02650 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax5Q02650 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms