Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra1P97785 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra1P97785 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.6 ms