Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cmklr1P97468 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cmklr1P97468 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmklr1P97468 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms