Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn1P62962 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfn1P62962 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfn1P62962 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms