Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc1a3P56564 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc1a3P56564 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms