Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgd1P52734 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgd1P52734 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgd1P52734 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgd1P52734 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms