Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GastP48757 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GastP48757 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GastP48757 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GastP48757 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GastP48757 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GastP48757 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GastP48757 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GastP48757 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GastP48757 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GastP48757 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GastP48757 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GastP48757 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GastP48757 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GastP48757 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GastP48757 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GastP48757 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GastP48757 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GastP48757 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GastP48757 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms