Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd4P46935 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nedd4P46935 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nedd4P46935 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd4P46935 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms