Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd2P46718 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd2P46718 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd2P46718 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd2P46718 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd2P46718 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd2P46718 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd2P46718 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms