Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpl28P41105 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl28P41105 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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