Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ly6dP35459 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ly6dP35459 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ly6dP35459 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms