Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab20P35295 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab20P35295 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab20P35295 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab20P35295 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab20P35295 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab20P35295 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms