Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc11P31313 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc11P31313 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms