Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga1P29974 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga1P29974 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga1P29974 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga1P29974 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms