Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VtnP29788 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VtnP29788 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VtnP29788 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VtnP29788 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VtnP29788 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VtnP29788 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VtnP29788 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VtnP29788 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VtnP29788 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VtnP29788 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VtnP29788 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VtnP29788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VtnP29788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VtnP29788 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VtnP29788 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms