Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprmP28828 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PtprmP28828 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PtprmP28828 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprmP28828 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprmP28828 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprmP28828 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprmP28828 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprmP28828 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprmP28828 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprmP28828 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprmP28828 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
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