Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc6a9P28571 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc6a9P28571 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc6a9P28571 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms