Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnna1P26231 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna1P26231 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms