Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bmi1P25916 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bmi1P25916 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bmi1P25916 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms