Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpm3P21107 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tpm3P21107 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpm3P21107 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms