Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fcer1aP20489 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fcer1aP20489 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fcer1aP20489 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms