Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtpraP18052 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpraP18052 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpraP18052 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpraP18052 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpraP18052 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpraP18052 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpraP18052 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpraP18052 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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