Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spi1P17433 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spi1P17433 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms