Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30aP15533 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30aP15533 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms