Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fgf4P11403 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fgf4P11403 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms