Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FlgP11088 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FlgP11088 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FlgP11088 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FlgP11088 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FlgP11088 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FlgP11088 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FlgP11088 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FlgP11088 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FlgP11088 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FlgP11088 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FlgP11088 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FlgP11088 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FlgP11088 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FlgP11088 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FlgP11088 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FlgP11088 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FlgP11088 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FlgP11088 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FlgP11088 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FlgP11088 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FlgP11088 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FlgP11088 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FlgP11088 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FlgP11088 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FlgP11088 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FlgP11088 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FlgP11088 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FlgP11088 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FlgP11088 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FlgP11088 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FlgP11088 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FlgP11088 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FlgP11088 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms