Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0C1Z5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0C1Z5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P0C1Z5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms