Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb2P0C1T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb2P0C1T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms