Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Prm2P07978 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms