Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03980 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03980 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03980 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03980 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03980 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03980 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03980 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P03980 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P03980 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P03980 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms