Protein–RNA interactions for Protein: P01802

Ig heavy chain V-III region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01802 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01802 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01802 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01802 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01802 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01802 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01802 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01802 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01802 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01802 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01802 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01802 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01802 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01802 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01802 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01802 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01802 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01802 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01802 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01802 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01802 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01802 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01802 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms