Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01739 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01739 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01739 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01739 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01739 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01739 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01739 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01739 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01739 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01739 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01739 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01739 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01739 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms