Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01679 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01679 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01679 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01679 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P01679 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
P01679 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
P01679 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01679 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01679 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01679 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01679 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01679 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01679 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01679 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01679 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01679 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01679 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01679 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01679 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01679 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01679 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01679 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01679 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01679 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01679 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01679 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01679 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01679 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01679 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01679 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01679 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01679 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01679 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01679 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01679 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01679 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01679 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
P01679 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01679 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms