Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx8O88983 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx8O88983 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx8O88983 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx8O88983 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx8O88983 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx8O88983 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx8O88983 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx8O88983 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx8O88983 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms