Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Orc4O88708 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Orc4O88708 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Orc4O88708 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Orc4O88708 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms