Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff1O88573 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aff1O88573 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff1O88573 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff1O88573 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aff1O88573 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aff1O88573 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff1O88573 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff1O88573 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff1O88573 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms